Está ambientado en una versión ficticia del área de Chicago. La trama gira en torno al personaje Aiden Pearce, un hacker que usa sus conocimientos informáticos para cometer crímenes. Luego de que asesinan a su sobrina tras intentar atracar un hotel, se transforma en un «justiciero» que busca vengar su muerte. En el juego, utiliza su teléfono celular como arma adicional y lo emplea para aprovechar los fallos del sistema de Chicago llamado «ctOS», un sistema informático centralizado que controla todos los dispositivos tecnológicos de la ciudad, y que almacena información detallada sobre sus habitantes.5​ Ofrece un mundo abierto que permite a los jugadores explorar diferentes lugares y realizar misiones secundarias.6​